医院设有心血管内科、消化内科、肾内科、神经内科、呼吸内科、内分泌代谢科、血液内科，重症医学科、胃肠外周血管外科、肝胆腺体外科、泌尿外科、故可、心血管外科、神经外科、普外科、疼痛科、妇科、产科、儿科、眼科、中医科、中医骨伤科、康复科、检验科、放射科、超声科等临床和医技科室。其中消化内科、眼科、中医骨伤科、临床护理为国家临床重点专科，儿科、肾内科、急诊科、重症医学科、神经内科、神经外科为自治区临床重点专科，心脏血管病科和消化内科为自治区重点学科和广西脑卒中中心、眼科、广西微创手术中心、骨科为自治区重点建设学科